瓊脂糖凝膠電泳是用瓊脂糖作支持介質的一種電泳方法。其分析原理與其他支持物電泳最主要區別是：它兼有“分子篩"和“電泳"的雙重作用。瓊脂糖凝膠電泳中使用的溴化乙錠（EB）為中度毒性、強致癌性物質，務必小心。所以在實驗過程中一定要嚴格按照瓊脂糖凝膠電泳步驟操作。下面我們總結瓊脂糖凝膠電泳步驟，僅供參考。

1、按所分離的DNA分子的大小范圍，稱取適量的瓊脂糖粉末，放到一錐形瓶中，加入適量的0.5×TBE電泳緩沖液。然后置微波爐加熱至充分溶化，溶液透明。稍搖勻，得膠液。冷卻至60℃左右，在膠液內加入適量的溴化乙錠至濃度為0.5μg/ml。

2、取有機玻璃制膠板槽，有透明膠帶沿膠槽四周封嚴，并滴加少量的膠液封好膠帶與膠槽之間的縫隙。

3、水平放置膠槽，在一端插好梳子，在槽內緩慢倒入已冷至60℃左右的膠液，使之形成均勻水平的膠面。

4、.待膠凝固后，小心拔起梳子，撕下透明膠帶，使加樣孔端置陰極段放進電泳槽內。

5、在槽內加入0.5×TBE 電泳緩沖液，至液面覆蓋過膠面

6、把待檢測的樣品，按以下量在潔凈載玻片上小心混勻，用移液槍加至凝膠的加樣孔中。1μl加樣緩沖液（6×）+5μl待測DNA樣品〔+0.5μlEB 液（10mg/ml）（注：若膠內未加EB，可選用此法）。〕

7、接通電泳儀和電泳槽，并接通電源，調節穩壓輸出，電壓最高不超過5V/cm，開始電泳。點樣端放陰極-端。根據經驗調節電壓使分帶清晰。

8、觀察溴酚蘭的帶（藍色）的移動。當其移動至距膠板前沿約1cm處，可停止電泳。

9、染色：把膠槽取出，小心滑出膠塊，水平放置于一張保鮮膜或其他支持物上，放進EB溶液中進行染色，充分浸泡約30min。

10、在紫外透視儀的樣品臺上重新鋪上一張保鮮膜，趕去氣泡平鋪，然后把已染色的凝膠放在上面。關上樣品室外門，打開紫外燈（360nm或254nm），通過觀察孔進行觀察。

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